Index of Thoughts & Articles

All Writings

An archive of long-form articles, technical guides, historical analyses, and working notes published over time.

আণবিক বায়োফিজিক্স ও কম্পিউটেশনাল কোষ (পর্ব ২০): জীবনের সূচনা: অ-ভারসাম্য তাপগতিবিদ্যা, প্রোটোসেল ও কৃত্রিম জীবনের দিগন্ত

জীবন কী? ১৯৪৪ সালে এরউইন শ্রোডিঙ্গার তাঁর বিখ্যাত বক্তৃতায় এই প্রশ্নের অবতারণা করে বলেছিলেন, জীবন্ত সত্ত্বা তার চারপাশের পরিবেশ থেকে “নেগেটিভ এনট্রপি”...

আণবিক বায়োফিজিক্স ও কম্পিউটেশনাল কোষ (পর্ব ১৯): কম্পিউটেশনাল কোষ: পূর্ণাঙ্গ কোষের মাল্টি-স্কেল গাণিতিক সিমুলেশন

এক শতাব্দীরও বেশি সময় ধরে আণবিক জীববিজ্ঞান এগিয়েছে একক উপাদান বিশ্লেষণের মাধ্যমে: একটি জিন বিচ্ছিন্ন করা, একটি প্রোটিন পরীক্ষা করা। কিন্তু ২০১২...

আণবিক বায়োফিজিক্স ও কম্পিউটেশনাল কোষ (পর্ব ১৮): মেটাবলিক নেটওয়ার্ক, স্টয়কিওমেট্রিক ম্যাট্রিক্স ও ফ্লাক্স ব্যালেন্স অ্যানালাইসিস

একটি জীবকোষে হাজার হাজার রাসায়নিক বিক্রিয়া একসাথে ঘটে। প্রতিটি এনজাইমের গতিবিদ্যার সুনির্দিষ্ট মান গবেষণাগারে নির্ণয় করা প্রায় অসম্ভব। সিস্টেমস বায়োলজি তাই এক...

আণবিক বায়োফিজিক্স ও কম্পিউটেশনাল কোষ (পর্ব ১৭): সিন্থেটিক বায়োলজি ও জিন সার্কিট ইঞ্জিনিয়ারিং: রিপ্রেসিলটর ও টগল সুইচ

২০০০ সালে জীববিজ্ঞান এক ঐতিহাসিক সন্ধিক্ষণে প্রবেশ করে: কেবল প্রাকৃতিক পর্যবেক্ষণ থেকে প্রোগ্রামযোগ্য প্রকৌশলবিদ্যায় রূপান্তর। জিন, প্রমোটার এবং রিপ্রেসারকে ইলেকট্রনিক ট্রানজিস্টর ও...

আণবিক বায়োফিজিক্স ও কম্পিউটেশনাল কোষ (পর্ব ১৬): জিন প্রকাশে স্টোকাস্টিক বিশৃঙ্খলা: কেমিক্যাল মাস্টার সমীকরণ ও কোষীয় নয়েজ

সাধারণ রাসায়নিক পাত্রে কোটি কোটি অণুর অংশগ্রহণে বিক্রিয়াগুলো অত্যন্ত মসৃণ ও সুনির্দিষ্ট মনে হয়। কিন্তু মাত্র ১ ফেমটোলিটার আয়তনের একটি জীবকোষের ভেতর...

আণবিক বায়োফিজিক্স ও কম্পিউটেশনাল কোষ (পর্ব ১৫): ক্রিসপার-ক্যাস৯: ব্যাকটেরিয়াল রোগপ্রতিরোধ থেকে আণবিক সার্জারি

ব্যাকটেরিয়া কোষে ব্যাকটেরিওফাজের আক্রমণ প্রতিহত করার একটি প্রাচীন প্রাকৃতিক রোগপ্রতিরোধ ব্যবস্থা হিসেবে শুরু হলেও, ক্রিসপার-ক্যাস৯ (CRISPR-Cas9) একবিংশ শতাব্দীর জীববিজ্ঞানের সবচেয়ে বৈপ্লবিক প্রযুক্তিতে...

আণবিক বায়োফিজিক্স ও কম্পিউটেশনাল কোষ (পর্ব ১৪): ডিএনএ মেরামত কৌশল: বেস ও নিউক্লিওটাইড এক্সিশন এবং হোমোলোগাস রিকম্বিনেশন

ডিএনএ কোনো অপরিবর্তনীয় জড় বস্তু নয়। মানবদেহের প্রতিটি কোষে প্রতিদিন প্রায় ১০,০০০ থেকে ১,০০,০০০টি ডিএনএ ক্ষত বা ক্ষতি সৃষ্টি হয়—যার মূলে রয়েছে...

আণবিক বায়োফিজিক্স ও কম্পিউটেশনাল কোষ (পর্ব ১৩): ডিএনএ অনুলিপিকরণ বিশ্বস্ততা, প্রুফরিডিং ও মিসম্যাচ রিপেয়ার

মানব জিনোমে রয়েছে ৩২০ কোটি ক্ষারক জোড়। প্রতিটি কোষ বিভাজনের সময় এই সুবিশাল তথ্যভাণ্ডার অনুলিপিকরণ করতে হয় প্রায় অলৌকিক নির্ভুলতায়: প্রতি সম্পূর্ণ...

আণবিক বায়োফিজিক্স ও কম্পিউটেশনাল কোষ (পর্ব ১২): এপিজেনেটিক্স, ক্রোমাটিন রিমডেলিং ও হিস্টোন কোড বায়োফিজিক্স

ডিএনএ-এর রৈখিক অনুক্রম যদি হয় জীবকোষের হার্ডওয়্যার, তবে এপিজেনেটিক্স (Epigenetics) হলো তার গতিশীল অপারেটিং সিস্টেম। ইউক্যারিওটিক কোষে দুই মিটার দীর্ঘ ডিএনএ কীভাবে...

আণবিক বায়োফিজিক্স ও কম্পিউটেশনাল কোষ (পর্ব ১১): জিন নিয়ন্ত্রণ, ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর ও ফ্যাসিলিটেটেড ডিফিউশন

একটি ব্যাকটেরিয়া কোষে ৪৬ লাখ বেস পেয়ার ডিএনএ-এর মধ্যে কীভাবে একটি নির্দিষ্ট ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর মাত্র কয়েক সেকেন্ডের মধ্যে তার সুনির্দিষ্ট ২০-বেসের টার্গেট...